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Il y a au moins trois méthodes pour mettre un graphique dans dans un document quarto : ggplot2, copier-coller, fichier image.

ggplot2

La façon préférée de faire un graphique est ggplot2. Elle est la plus flexible, permet d’avoir une source unique, peut être facilement modifiée (uniformisation, traduction, correction, raffinements) et s’intègre parfaitement en html et en pdf.

Avec un faible coût on peut rendre le graphique interactif (avec plotly ou ggiraph).

Un graphique ggplot doit contenir une couche (layer) theme_ofce() et limiter au maximum les définitions de taille (par exemple de police de caractère). Ces définitions doivent être faites de façon globale pour assurer l’homogénéité. Il est important de ne pas définir la taille de la figure, ça risque de produire des images avec des caractères trop petits.

Pour changer les dimensions d’un graphique, il faut utiliser1 #| fig-asp : x ou x est le ratio entre la hauteur et la longueur. 0.61 est la valeur par défaut et correspond au nombre d’or soit entre 16/9 et 16/10. Pour des graphiques particuliers (par exemple deux graphiques empilés ou une carte) on peut mettre 1 (format carré) ou 1.4 quand on veut prendre toute la page A4.

Le code d’un graphique ggplot2 :

#| label: fig-tauxapp
#| fig-cap: Taux de taxation apparent sur le patrimoine des ménages
#| fig-asp: 0.61
# pas besoin d'en mettre plus, echo, message, warning sont déjà définis

data <- readxl::read_xlsx(
  "analyses/Tables/patrimoine menages.v2.xlsx",
  sheet = "tapp")

names(data) <- c("date", "vn", "pib")
data <- data |> mutate(date = lubridate::ym(str_c(date, "-01"))) |> 
  pivot_longer(cols  = c(vn, pib)) |> 
  mutate(name = factor(name, c("vn", "pib"),
                       c("En % de la valeur nette", "En % du PIB")))
                       
# un ggplot et ses différentes couches
ggplot(data) + 
  aes(x = date, y = value, group = name, col = name, fill = name) +
  geom_line(linewidth = 1) +
  geom_point(shape = 21, col = "white", size = 2) +
  theme_ofce(legend.position = "bottom") +
  scale_x_date(date_breaks = "2 years", date_labels = "%Y", 
               date_minor_breaks = "year") +
  PrettyCols::scale_color_pretty_d(name = NULL, palette = "Summer") +
  PrettyCols::scale_fill_pretty_d(name = NULL, palette = "Summer") +
  ylab("Taux apparent") + xlab(NULL) +
  scae_y_continuous(labels = \(x) str_c(x, "%")) +
  labs(caption =
         "La fiscalité sur le patrimoine est composée ici de la taxe foncière payée par les ménages, <br>
       des droits d'enregistrement sur les transactions immobilières, des droits de mutation sur les successions et les donations et de l'Impôt sur la Fortune Immobilière (ex-ISF)<br>
       *Sources* : Insee, calculs OFCE")
1
Les données sont dans excel – elles pourraient venir de R ou d’ailleurs. La feuille tapp est formattée simplement
2
Utilisez le theme_ofce pour uniformiser l’aspect des graphiques
3
scale_date est important lorsqu’on présente des données temporelles, il faut penser à convertir les dates en dates (as.Date() ou lubridate::ymd() et consorts), même si les dates ne sont que des années.
4
Le choix des couleurs est tjrs délicat, Paul Malliet est un maître en la matière, uniformiser ses choix de couleurs le long d’un document c’est bien, donner une signification à ses couleurs c’est mieux, quand en plus c’est harmonieux, c’est PM (plus que mieux ou Paul Malliet)
5
Les sources – notez qu’on ne met pas de titre au graphique (voir la section références croisées)

Copier-coller

On peut copier coller un graphique (de word, d’excel, d’ailleurs) dans le mode visuel de RStudio. Ça marche mais c’est pas le mieux. Quand on copie colle, on fait quelque chose qui ressemble à l’option qui suit.

Image au format png/jpeg/jpg/svg

On peut enregistrer une image (au format que l’on veut, quarto accepte pas mal d’options, dont les plus courantes) et l’insérer dans le texte. Il y a deux façon de faire soit en markdown (dans le qmd, comme un lien ou autre chose), soit en utilisant include_graphics. L’intérêt par rapport au copier-coller est que si on change le fichier qui contient l’image, à chaque render du document, la bonne (la dernière version) image sera utilisée. Si on utilise des images venant de eviews 💀 ou stata 😵, c’est la meilleure méthode.

[Titre de la figure](rep/fig.png)

Le répertoire est toujours relatif.

Jamais de chemin absolu comme “c:/user/machin/montravail/monrepo/monimage.png” parce que ça ne marchera pas sur un autre ordinateur et en plus github ne copiera pas l’image) et par celui qui contient le .qmd. Il est toujours possible de mettre les images dans un sous dossier.

Plus c’est simple et clair, mieux c’est (i.e. gardez les noms courts, explicites, pas de majuscules, bien rangés, conservateurs dans l’utilisation des caractères (pas d’accents, pas de blancs, pas de symboles spéciaux). Donc donnees/img.png ou donnees/graphique 1a5.png ne sont pas des bons noms. Mais figures/revenu.png ou figures/pib_par_tete.png sont mieux.

#| label fig-pib2008_2024
#| fig-cap: PIB entre 2008 et 2024

knitr::include_graphics("pib2008_2024.png")

Notez la cohérence des id, nom et titre.

Les autres packages

On peut faire des graphiques avec d’autres packages dans R, voire même utiliser base R. Nous ne recommandons pas cette voie, parce qu’elle rend très difficile l’harmonisation des graphiques et les fonctionnalités avancées. Parfois, cependant, il n’y a pas d’autres solutions.